Время шло и не щадило даже самых сильнейших. Пришло время и «непобедимые» Акацуки были повержены, своей смертью дав возможность хвостатым демонам освободиться. Биджуу опять освободились и начали наносить новые бедствия. Некоторые из них были заточены при попытках захватить селения, в то время как многие другие всё ещё оставались на свободе, нанося Пять Великим Странам Ниндзя и многим другим странам огромный вред.
Вскоре после этого началась Великая Война, которая охватила все закоулки мира шиноби. Не сумев разделить власть, горстка людей развязала войну, которая охватит абсолютно всех и впредь навсегда запомниться как самая ожесточённая война в истории мира. Семь лет продолжалось кровопролитие, какого мир ещё не видал. Скрытый Лист объединился со Скрытыми Песками, Скрытый Туман заключил договор со Скрытым Дождём и Скрытым Водопадом, вместе выступил Скрытый Камень и Скрытая Трава, а Скрытый Звук и Скрытое Облако атаковали в одиночку. Путь многих выдающихся шиноби оборвался именно на этой войне. Многие запечатлели свои имена в истории, отдав свою жизнь за родное селение. Эта война никого не щадила. Горечь потрясла две самые сильнейшие страны ниндзя- шестой Хокагэ Узумаки Наруто был убит от руки Райкагэ во время атаки шиноби Скрытого Селения в Облаке на Скрытый Лист, пятый Казекагэ Сабак но Гаара пал в бою с Цучикагэ. Это небывало ослабило Скрытый Лист и Скрытые Пески, но никто всё ещё не видел завершения этой войне. Каждая страна сражалась, проявляя не виданную жестокость и желание выжить, а так же небывалую мощь, ведь в бой были брошены самые могущественные шиноби. Это была война, которая чуть не потопила мир в крови.
Настало время, и мир совсем ослаб от войны и бедствий, принесённых ею. Многие кагэ пали, и Старейшины решили положить конец холодной, ожесточённой войне, которая вела мир к Концу Света. Многие селения грозились исчезнуть с лица света. Решение нужно было принять немедленно. Все селения опустошились и были практически разбиты. Вскоре грозилась создаться невиданная ситуация - воевать было бы некому. Старейшины собрались и объявили так желанный годами мир. Кажется, весь свет возликовал в тот миг. Постепенно началось восстановление всех стран и селений. Мир набирал воздух и дышал во все лёгкие.
Семь лет прошло с объявления о мире и восстановление не остановилось ни на секунду. Медленными шагами залечивались раны, нанесённые войной. И опять в мир вернулся период цветения сакуры – зримые следы Великой Войны были почти заметены, селения - восстановлены, выбраны новые кагэ…. Жизнь возвращалась в своё русло. Начались новые времена, именуемые Временами Расцвета.
Но не все гладко, как кажется на первый взгляд. Так новым Хокагэ Конохи стал сын Конохомару – двуличный и жестокий Сарутоби Такаши, стремящийся к власти. Его амбициям нет границ, и он разработал новую запретную технику – технику Трёх Лун, что бы завоевать мир, и подчинить себе другие Скрытые Деревни. Суна, узнав о планах нового Хокаге, расторгла союз с Конохой, и стала объединяться с другими Скрытыми Селениями. Другие селения тоже стали объединяться, так как побоялись быть уничтоженными, но на данный момент это всё протекает весьма не открыто, и на лице Мира Шиноби цветёт улыбка Дружбы между селениями.
Сейчас Скрытые Селения хоть как-то пытаются восстановиться... Возобновились экзамены на чуунина, но недоверие между враждующими странами не улеглось, хотя они и пытаются наладить прежние отношения. Но на горизонте маячит зарождение новой, еще более страшной войны, чем доселе...
Дабы получить большее влияние и силу, многие селения стали прибегать к услугам Ассоциации Наёмников, лидером которой является эксцентричная шиноби, даже имя которой никому неизвестно. Поскольку многие селения пользуются услугами этих наёмников, прибыль Ассоциации быстро возрастает, и появляются шиноби, которые стремятся стать главой Ассоциации, но никому пока не удалось убить эту куноичи.
Тем временем, появились слухи о новой организации – «Рокугороу», говорят, что эта организация – последователи Акацуков, которые хотят довершить планы старой организации… «Рокугороу» и глава Ассоциации Наёмников находятся не в самых лучших отношениях. Поскольку наёмники начали составлять конкуренцию новой организации, они стали враждовать, и пытаются уничтожить один другого.